康熙六十一年十一月十三日，康熙帝在北郊畅春园病逝，四阿哥胤禛继承了皇位，次年改年号雍正。即位后，雍正帝重用康熙十三子胤祥，不想放过政敌胤禩等人，胤禩等人也不甘心失败，所以双方的斗争在雍正帝继位后延续下来，他在政治上采取多种措施以巩固自己的皇位。
雍正也的确按照邬思道的计谋，首先是消除异己，分化瓦解诸皇子集团，将十四阿哥胤禵从西北军前召回，加以圈禁。晋封八阿哥胤禩为廉亲王和总理事务大臣。将九阿哥胤禟发往青海西大通（今青海大通西北）。鉴于清朝没有行之有效的立储制度，常因皇位继承权产生争端，创立了秘密立储制度。
二年春以前，雍正对政敌的打击尚有所节制，这是因为政权还不太巩固，不便太刺激对方。此时大清西北战事吃紧，八阿哥对此也是等着看雍正的笑话。当此非常之时，作为西北重要将领的年羹尧更是倍受倚重，和隆科多并称雍正的左膀右臂。隆科多是胤禛的亲郎舅，在胤禛继位前已为他效力多年，二人关系甚为亲密。
早在雍正元年五月，雍正发出上谕：“若有调遣军兵、动用粮饷之处，著边防办饷大臣及川陕、云南督抚提镇等，俱照年羹尧办理。”这样，年羹尧遂总揽西部一切事务，实际上成为雍正在西陲前线的亲信代理人，权势地位实际上在抚远大将军延信和其他总督之上。雍正还告诫云、贵、川的地方官员要秉命于年羹尧。同年十月，青海发生罗卜藏丹津叛乱。青海局势顿时大乱，西陲再起战火。雍正命年羹尧接任抚远大将军，总督各军，驻西宁坐镇指挥平叛。
当时年羹尧初到西宁，大军未集，被罗卜藏丹津得知，于是率军偷袭，直取西宁。年羹尧率左右数十人坐于城楼上，毫不慌张。罗卜藏丹津以为有诈，率军引退。年羹尧令兵攻击贼垒，敌军认为年羹尧兵少，不为防备，驱桌子山土番当前队；炮发，土番死者无算。岳钟琪兵至，直攻敌营，罗卜藏丹津败逃，仅率百人遁走。
到了雍正二年初，战争的最后阶段到来，年羹尧下令诸将“分道深入，捣其巢
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