延历寺帮助浅井家一事复仇，所以恳请信长此行只针对一向宗，千万莫要向比睿山出手，信长应允，这才发兵。
然后到了比睿山下，信长忽然变脸，下令包围比睿山，准备最大规模的屠杀！
佐久间信盛闻信长所言如同晴天霹雳，一时间竟忘记了自己身份，指责信长出尔反尔，全无信义，又目无神明，他日必有报应！
信长大怒，要斩信盛，众将急忙跪求信长，说大战之前斩将不利，尤其信盛又是宿老，斩之必有损于士气。信盛此时也知自己方才失了理智，出言过激，慌忙下跪，鸡啄米般磕头。信长这才略消了气，喝令退下，准备上山。
一声令下，织田家大军由打比睿山四面八方似潮水般涌上，见人就杀，无论文武僧人、妇女、亦或儿童，总之信长有令，但凡首级，便可领赏！
于是，屠杀持续将近一夜，天亮时方止，山上除了织田军，再无活人，尽是尸体，满山遍野，至少有四五千具！
信长也一同上了山，到延历寺前，仰天长笑，笑至最后，隐约似有女声方始停下，低声道：“烧山！”
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天色大亮，比睿山大火稍息。延历寺百余年积攒下的佛经、佛像，毁于一旦，尤其受全国祭拜的著名的山王二十一社与根本中堂，化为焦土，随山风而逝。
消息转眼间传遍全国，举世震惊，本愿寺方丈本愿寺显如更是抓到了确实证据，向天下发布宣言，指信长为佛敌！一时间，各地暴动愈演愈烈，不止在信长的土地上，不止是一向宗教徒，只要有佛教的地方，便不再安宁！
而唯一令众人感到奇怪的事，信长此行本欲借镇压南近江一向一揆的名义，直指本愿寺，希望能依仗之前的胜势啃掉这块硬骨头，而本愿寺一方，也确实做好了准备，不但做好了寺内上下的动员，也叫来了根来与杂贺的忠实帮手铁炮队。但就在这举世尽皆侧目观望之际，火烧比睿山之后，信长大军竟乘胜撤退了，比来时更。
虽然不知道是什么原因，但不止是本愿寺，全天下都松了一口气。先说将军，比睿山就在京都郊外，将军一直担心信长假道伐虢，顺手废了自己的将军之职，毕竟，他心里是真的有鬼。
而三好家心里也不安稳，虽然偷袭义昭之后，自己再度厚着脸皮请降，包括松永久秀也递交了降书顺表，但是信长的脾气谁也摸不透，说不准他表面去攻打本愿寺，随便拐个弯就来三好家了。
另外还有一干小势力，都觉得信长会报之前金崎撤退时自己趁火打劫的仇，也是惶恐不可终日，甚至有些家督已经连遗书都留好了，哪知哭哭啼啼了几天，信长竟然没理自己，转身回了岐阜，真是白担惊受怕了一场，暗地里拜个佛，总算睡了场安稳觉。
可是，信长确实做了攻打本愿寺的准备，要不然，也不会带上柴田胜家等大将了，但是，究竟是为什么忽然退兵了呢？难道，真的像民间所言，织田信长在火烧比睿山之后，遭了神罚，大病不起了？