盛的宦官集团，他们为非作歹，无恶不作，严重的威胁国家权力的运行，一些正直的官员上疏请求严惩不法的宦官，结果大多反招祸端，惹來杀身大祸，太监陈增为矿税太监，骚扰山东，弄得民不聊生，生灵涂炭，哀歌遍野，山东巡抚尹应元劾奏陈增二十大罪，却遭到罚俸的处罚（《明史?宦官二?陈增传》），大明天下一片黑暗，人民生活苦不堪言，灾难深重。
其实，认真说來，宦官横行历朝历代的情况大同小异，宦官专讨皇帝的喜欢，忠臣则规劝皇帝的过失，所以皇帝大多喜欢宦官的阿谀谄媚，而不喜欢忠臣的耿直良言，只不过万历皇帝厉害罢了，越演越烈。
时下，在一些单位也是这样的情况，那些在领导身边工作的人，不管什么人都会想方设法的察言观色，讨领导喜欢，他们每天就生活在领导的身边，对领导的思想脉搏了如指掌，往往能往领导的心里做事，作为领导也是人，也用七情六欲，既需要有人拉车，当然也需要有人在一旁侍候，侍候人的活当然轻松，领导就要让喜欢的人來做，这个人便抖了起來，威风里许多，说话办事趾高气扬起來，一副高级奴才的嘴脸，和封建年代的太监一个模样。
这个时期，因为朝中大臣不能跟皇帝直接沟通，官员升迁制度也日益混乱，朝廷中一些大臣就自立门户，于是，朋党竞起，互相倾轧，势同水火，扰乱是非，于是，就出现了第三种情况：党争日烈。
第三、党争激烈。
先是出现东林党：“吏部郎顾宪成讲学东林书院，海内士大夫多附之，‘东林’之名自是始！”（《明史?宦官二?魏忠贤传》）后來，楚党、浙党（大学士沈一贯始）、齐党等相继而起，而后又出现阉党，到万历四十年（1612年）前后，朋党已成，各持己见，互相攻击，搅得朝政是非难辨，乌云翻滚，辽东大员熊廷弼、孙承宗、袁崇焕的任免、升降、荣辱、死生等，都同党争有直接的关联。
这实际上就是一个个小团体，就像文革期间，在轰轰烈烈的群众运动中，各种组织风起云涌，三五个人，百十个人就组成一个什么组织，山头林立，大家都认为自己是最革命的，最拥护毛主席，对毛主席最忠，相互之间，你争我斗，为了小团体的利益不惜牺牲国家的利益，你方唱罢我登台，文攻武卫，弄得乌烟瘴气，国家动乱不堪。
二、财政枯竭
万历腐败怠政，又挥霍无度，造成财政枯竭，国力大降，具体说來：
第一、军费浩大。
三大征：平哱拜之乱，花费银200万两；援朝抗倭，花费银700万两；平定播州之乱，花费银300万两，总数大约有1200万两，这是万历皇帝的一大政纪，但虽然取得了重大的军事胜利，也加重了国库的负担。
战争是吃钱的机器，任何强大的国家都经不起几次大的战争，美利坚合众国在二次大战后之所以逐渐成为世界最强的国家，很大程度上就是因为美国国内自南北战争以后的几百年沒有发生过战争 ，他们把战火烧到别人的土地上，在发展战争财，或者挑起民族冲突，向受害的国家受害人买枪支弹药，大捞油水，八国联军侵略中国，气势汹汹
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