新四军军长陈毅。黄克诚时任新四军三师师长兼政委，他实在看不惯饶漱石的所作所为，批评饶漱石：“无论如何，让陈毅军长离开华中，是个很大的损失。毛泽东和朱德同志在一起工作多年，彼此也有过不同意见，但他们却始终团结合作得很好。你刚来不久，就想把陈毅同志挤走，实在不应该。你这种做法很不光明磊落，不是共产党人的作风。”他的直言不讳的批评，使饶漱石敢怒不敢言；1943年7月15日，中共中央社会部部长康生在延安干部大会上作了《抢救失足者》的动员报告，掀起了所谓“抢救运动”，要求对全党干部进行一次组织审查，造成了大批冤假错案。黄克诚在所领导的新四军3师7旅搞了一下试点，发现有一半的人需要“抢救”，感到这与当年中央苏区抓“ab团”分子如出一辙，便一边向上级打报告表示反对，一边下令在本师不搞“抢救运动”。一些好心人劝他说：“和上面对着干，会有麻烦的。”他说：“我宁愿错放，也不能错杀。”为此，他又被扣上一顶“右倾”的帽子；1946年4月，国民党军队集中8个军的兵力攻打四平，林彪指挥10万大军与敌人在四平一线展开激战。毛泽东先后给林彪发去十多份电报，要求坚守四平。黄克诚向林彪提出撤退的建议，林彪不予理睬，黄克诚便于5月12日直接致电中央。5月19日，毛泽东给林彪发去电报：“如果你觉得继续死守四平已不可能，便应主动放弃四平，由阵地战转为运动战。”1959年毛泽东对黄克诚说：“固守四平，是我决定的。”黄克诚说：“是你决定的也是错误的。”毛泽东一时无语，稍后自语道：“那就让后人去评说吧。”；1959年7月，彭德怀在庐山会议上因反对“大跃进”等“左”的错误，上书毛泽东提出不同意见，在大会上受到批判。黄克诚在会议中间被叫到庐山批判彭德怀，却在会上公开表示同意彭德怀的看法。中央常委***、周恩来等找黄克诚谈话，要他与彭德怀划清界限，但他仍“执迷不悟”。黄克诚在关键时刻的表现，让毛泽东深深失望了。结果，黄克诚被撤销中央书记处书记、军委秘书长兼总参谋长职务，打入“彭德怀反党集团”，一顶右倾帽子整整戴了20年。
黄克诚一生因为讲真话被多次批判、多次罢官，但他始终无怨无悔、矢志不渝。晚年在被罢免，20年复出后，对一些重大敏感问题，他仍以捍卫真理的巨大勇气，坦诚讲出心里的真话。在任职期间，他坚决贯彻中共十一届三中全会的路线、方针、政策，为平反冤假错案，重建和健全党的纪律检查工作，端正党风，正确评价毛泽东的历史地位和作用，做了大量工作。1980年11月，黄克诚在中纪委会议上说：“如果把建国以来党所犯的错误都算在毛泽东身上，让他一个人承担责任，这样做不符合历史事实。过去解放新中国，建设新中国，这些老共产党员都尽了一份责任，功劳大家有份。现在把错误都算在一个人身上，好像大家没有份，这是不公平的。大家应当来分担应当分担的责任，那才符合历史事实，符合唯物主义。”社会上曾一度出现西方化思潮，恶意诋毁毛泽东主席形象，企图丢掉毛泽东思想时，黄克诚更是实事求是，旗帜鲜明：“小平同志讲的‘没有毛主席，至少我们中国人民还要在黑暗中摸索更长时间’绝不是溢美之辞，而是对历史公正的科学论断。这样讲，并不是溢美之辞，而是对历史的科学论断。这样讲并不是把毛主席捧为救世主，也不是抹杀其他革命者的功劳。毛主席作为我们党和国家的主要缔造者，多次在危机中挽救了革命，这是我们党内任何人都不能比拟的。”“反右是必要的，只是扩大化了，错批了很多人，不能算毛主席一个人的错误，丑化扭曲毛主席就是丑化扭曲我们的党，丑化扭曲毛主席就是丑化扭曲中国革命，丑化扭曲毛主席就是丑化扭曲社会主义中国，毛主席的错误是一个伟大的无产阶级革命家犯的错误，有些人收到过打击，就从感情因素出发来诋毁毛主席，我也受到过打击，并且很严重，但从国家利益出发，应该肯定毛主席的伟大功绩，毛主席晚年同样很有雄心，本来要几百年才能完成的事，毛主席却想用几十年来完成。”“西方的生活水平是比我们高，但资本主义已经搞了几百年了，而我们才搞了三十年的社会主义，不要把西方都讲的那么漂亮，那里黑暗的东西多得很，如黑手党，各种毒品，搞赌博、卖淫等等那些乌七八糟的东西，如果我们的国家也搞成这个样子，怎么得了呢？难道这就叫文明？就叫幸福？丢掉毛泽东思想，造成党和人民的思想混乱，我们的社会主义国家就会变质，子孙后代就会受罪，不能不看到这个危险。今天我们要团结人民战胜困难，聚精会神，同心同德搞四化，还要靠毛泽东思想。比如，要纠正党内不正之风，就要靠毛主席长期倡导的理论联系实际，密切联系群众，批评与自我批评以及艰苦奋斗等一些列优良传统和作风，不能因为我们今天执政，当了“官”就丢掉这个宝贵的传统，贪图享受，吃喝玩乐，看一些乌七八糟的电影，这不是生活小事，这样的歪风邪气不制止我们就会脱离群众，就会腐败下去。当然，我不是说毛主席的每一句话都正确，他的某些话是讲错了或者是过时了，但毛泽东思想的精髓和基本原则却永远是我们中国共产党和革命人民的精神武器，知道我们不断将革命推向前进。”“现在全世界很多国家存在着‘信仰危机’，很多年轻人都感到思想没有出路，没有精神依托。我们中国共产党人在长期的斗争中树立了自己崇高的理想和信仰，并以此团结和教育了广大群众，我们不能毁掉自己的信仰。”“毛泽东思想作为一个科学体系，有一个不断丰富和发展的过程。我们不应苛求前人，只能通过我们后人的斗争实践弥补前人的不足，不断丰富和发展毛泽东思想，在这面光辉的旗帜下写下新篇章。”黄克诚对毛泽东的评价让所有人热泪盈眶。特别是他对林彪的评价，在当时的政治气氛和历史背景下，确实需要超人的政治勇气。当时，《中国大百科全书·军事卷》写了关于林彪的条目，请黄克诚审定。他读完条目说：“林彪的条目不能这么写，这样是不能向后人交代的。”黄克诚让秘书把编写《中国大百科全书·军事卷》的有关同志召集在一起，开门见山地对他们说：“你们写的这个条目，需要修改。你们要学司马迁，要秉笔直书，要对历史负责。林彪在军队历史上是有名的指挥员之一。后来他犯了严重罪行，是死有余辜。在评价他的历史时，应该分为两节：一节是他在历史上对党和军队的发展、部队战斗力的提高，起过积极作用；另一节是后来他对党、对军队的严重破坏，造成了极为严重的后果。这两方面都写明确，不含糊其辞，才符合历史事实。”
在中国革命漫长历史的将帅群中，大将黄克诚一生充满了曲折，征途上历尽了坎坷。但他屡受挫而初衷不改，临逆境而信念执著。恰是在艰难挫折中，显示了他坦荡的襟怀和高尚的品格。曾被陈云同志赞誉“一代楷模”。1986年12月28日，黄克诚在北京病逝。夫人唐棣华在挽联中写道：“即死无憾矣，仰不愧天，俯不怍人。”“苟利国家生死以，岂因获福避趋之。”是黄克诚将军的真实写照。