为副手，可惜连战太迟表态，总统府对宋又冷嘲热讽，结果连战只好找行政院长萧万长为副手参选，而**则脱党参选。
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*在1996年总统大选中，彭明敏及谢长廷的配搭对上**惨败，但同时在国大代表选举中得到可以否决修宪的席次，使国民党不能一党修宪。
*在1996总统大选后，党主席施明德辞职负责，第五届党主席、前桃园县长许信良当选第七届党主席。一直致力於参选总统的他，被**深夜请到总统府协商修宪事宜，被党内视为“主席夜奔敌营”。**召开国家发展会议，**以冻省来交换行政院长由总统委任，在目的达到后不再续滩。两党联手进行第四次修宪，但被人称为“一件西装换四条内裤”。
1997年3月，国民党籍的桃园县长刘邦友被枪杀，桃园县长补选，被视为年底县市长选举的前哨战，结果由立委**胜出。年底选举，*一举攻下多席县市长，使国民党执政的基隆市、台中县市等变天。
1998年，北高市长及立委选举，*的最大位阶的民选首长，台北市长**被超人气的国民党籍候选人马英九击败，未能连任，但高雄市长则由谢长廷夺下。
1999年，许信良参与总统初选，初时认为**被党内公职参选相随时间的限制而未能参选，但结果党内修改条款给**参选。结果由**打败许信良得到总统提名。许信良退党参选。
选战过程
在选举最后关头，台湾的中央研究院院长、诺贝尔化学奖得主李远哲公开支持**，也为**带来大量选票。
选举结果
这次选举是*的首次胜利，国民党在选前的分裂无疑对**的当选有很大的帮助。国民党内**、连战两派人马在选前未能整合成功，较高声望的**最后宣布退出国民党，独立参选。这最终导致国民党选民票源分散，**最后以30多万票的微弱差距落选，而连战则惨败。
在选票的结果上可看到，国民党是一面倒惨败。传统的国民党支持者全部倒向**，而本土的支持者也全部倒向**。正如有人分析的一样，**的两个图腾，外省的代表以及本省的代表分别被**与**抢走。
无论在马英九执政的台北市、立法院长王金平的高雄县，传统执政的花莲县、台东县等。一面倒倒向**。国民党执政的嘉义县也倒向**。而*从国民党手上抢得执政的桃园县、新竹县市、台中县市、以及南投县也倒向**，可显示**取得了国民党共主的地位。
**之所以差三十万票，一来是他的外省人身份，二来是兴票案使他失去了大量中间选票，加上李远哲临门一脚，使中间选票流向**处。三来是连战因为**弃连保扁的耳语，加上中共朱总理一席严词警告**的说话,使支持**的本土票大量流向**，使连战失去与**相峙不下的机会。反变成连宋相争，阿扁得利。
也有人认为，国民党的分裂是当时的党主席**造成的。因为有很多机会把宋拉回国民党，但**却没有做到。甚至运作整个国民党机器追击**。有强烈**色彩的**，虽然支持连战，但是很多人相信他在暗中支持**并使其当选。因为在整个选战上，他对**穷追猛打，对**则轻轻带过。有一次，他参与国民党的做势活动，形容宋是烂苹果，而扁则是青苹果
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