区而言，通常每年4月至10月为旱季，11月至次年3月为雨季，没有夏季或冬季的极端情况。
水系分布
印尼河流众多，水量丰沛，但都比较小。较大的河流有爪哇岛的梭罗河以及加里曼丹岛的巴里托河、卡普阿斯河、马哈坎河，其中梭罗河全长560公里。较大的湖泊有多巴湖、马宁焦湖、车卡拉湖、坦佩湖、托武帝湖、帕尼艾湖等，其中苏门答腊的多巴湖为印尼第一大湖。
生态
印度尼西亚地处热带，加上面积、群岛地形因素，而得以支持世界第二高的生物多样性，仅次于巴西，动植物混和了亚洲及澳大拉西亚品种。巽他陆棚上的岛屿（苏门答腊、爪哇、婆罗洲和巴厘岛）曾与亚洲大陆相连，而有许多亚洲动物相，如虎、犀牛、猩猩、亚洲象及豹等，曾大量栖息于东至巴厘岛的区域，但现今数量及栖息地已大幅减少。森林覆盖率约60％。在苏门答腊及加里曼丹以亚洲物种占优势；爪哇岛面积较小且人口密度高，大多数森林因人类居住及农业开垦而被砍伐。苏拉威西、努沙登加拉、马鲁古等地长期与大陆分离，演化出特殊的动植物物种；巴布亚的特有种与澳大利亚较为相近。
印度尼西亚的特有种数量仅次于澳大利亚，栖息于印度尼西亚的1,531种鸟类及515种哺乳类特有种中分别占36％及39％。印度尼西亚海岸线长约54,716公里，存在海洋及海岸多种生态系，如沙滩、沙丘、河口湾、红树林、珊瑚礁、海草、泥滩及潮间带等生态系。印度尼西亚东部位于珊瑚大三角（Coral Triangle）的范围内，该区域约有1,650种珊瑚鱼。英国自然学家阿尔弗雷德·华莱士提出分隔亚洲及澳大利亚物种间的隐形界线，即华莱士线，该界线大致沿着巽他陆棚边缘，于加里曼丹及苏拉威西间，于小巽他群岛位于巴厘岛及龙目岛间的龙目
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