有利于思想解放，有利于文化启蒙。但它的弊病也十分的明显，那就是空疏，一个个口若悬河，说起来那是长江黄河涛涛不绝，但心中所学有限，无补实事。所谓“平日袖手谈心性，临难一死报君王”，虽气节可嘉，于国家却十分不利。
因此，在看完张居正奏折的那一刻，出于君王巩固统治的本能，万历几乎就要批准了。冷静后，万历御批道：“孔子有弟子三千，朱子有书院之教，兴教化，顺阴阳，禁之不详。今大明子民立书院﹑讲学﹑游学﹑版刻文集等事朝廷皆不禁止。如果作奸犯科﹑阴谋不规，则依《大明律》处理。”
御批到了内阁，遭到内阁张居正申时行等阁臣的一致反对，将御批驳了回来。万历细想了一下，仍然坚持自己的意见，单独召见张居正和申时行二人，讨论此事。几个月后，才说服二人。
对东夷和西洋诸国贸易的兴盛，财政上有所好转。强大的江南水师保障了海疆的安全，帝国的商队已经能顺利的航行于东西洋。从隆庆元年开放海禁，到万历初完全开放，到现在已经十多年了，明商的航海能力大有提高。香江商会和闽江商会的商船能经三宝龚，穿越马六甲进入小西洋。另一大商会浙江商会则扬帆于东洋，往来朝鲜东瀛琉球等国。顺畅的海路带来巨大的利益，海商之富渐渐有超越晋商徽商之势，成为国内第一，也给朝廷带来了大笔的收入。
帝国本土商会的活跃，极大的打击了依靠中转贸易的澳门，葡萄牙人的势力受到了遏制，而吕宋岛上的西班牙人却因此兴盛起来，他们开辟了从吕宋到美洲的新商路。满载大明货物的商船穿越太平洋到达美洲，然后穿过麦哲伦海峡，在美洲欧洲之间进行奴隶贸易，最后装着白银绕过好望角返回东亚，从大明商人手中购买货物，完成一次环球贸易。
海上贸易
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