袁世凯是一直怀疑李少启的忠诚的，只不过当初碍于淮军的影响力，再加上北洋军根基薄弱，无法控制全国，才启用了看起来恭顺的李少启。
可是李纯叛变完全在袁世凯意料之外，几乎一点征兆也没有，袁世凯记得护国战争爆发前，李纯传来河南治理的条条佳绩，护国战争爆发后，对于河南辖地内的叛乱，李纯更是传来条条捷报。
可是让袁世凯想不通的是，这个逢年过节都给自己送礼，很讨自己喜欢的部将怎么会在一夜之间反了？
河南镇乃天下之心，河南镇一反，陕西吴佩孚被隔绝在西北，江浙陆建章，广东孙传芳被隔绝在东南，北洋主要势力段祺瑞和冯国璋的军队被钳制于北方，若要下南方平叛，就有后路被截断的顾虑。
河南镇的叛变，一下子将北洋军的主动地位变成了被动地位。
而李少启的江南镇，袁世凯是一直派人监视着的，包括在江南军内部安插亲信将军，可是李少启乘着东南的陆建章吴佩孚陷入战争泥潭，无暇顾忌江南时，一举拿掉了袁世凯的所有北洋亲信，这些人早就在李少启的谍报之内，只是一直装不知道而已。
而江南军的爆发力远远超过袁世凯的想象，护国战争之前，李少启上报的军队是五万，这与北洋在两湖云贵调查的数字相同。
可是就像李少启能撒豆成兵一般，李少启宣布独立后，一下子冒出近十万军队，装备齐全，训练有素，李少启似乎与河南李纯有密约，江南军除了两万防守东部陆建章与孙传芳外，其余全部军队涌向重庆，欲一举打开进入川藏镇门户。
重庆镇守张作相与保安将军李元华调集重庆两万军队誓死抵抗，由于敌我力量悬殊，紧急向成都求援，而成都此时除了两万士兵，只有程德全等一众文官留守。
四川本来一直对李少启有提防，但是没料到李少启军队如此之多，更没料到李少启会趁着赵建国失踪，四川人心惶惶之际出手，整个川藏一时岌岌可危。
而就在北洋政府陷入护国战争泥潭时，日本也在酝酿一场惊天政变。
自日本败退东北、朝鲜，并被赵建国袭击马关以后，日本不但丧失了甲午战争的巨额赔款，还蒙受了国耻，以致国内经济凋敝。
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