话分两头，在罗少伟副师长牺牲以后，解放军第一兵团兼新疆军区成立了剿匪指挥部，总指挥王震，副总指挥塞福鼎，参谋长张希钦。
紧接着，在匪患最为猖獗的北疆地区又成立了北疆前线指挥部，前敌总指挥为六军军长罗员发。
然后，以解放军第六军为主力，抽调了二军、五军、九军等各一部分部队，组建了剿匪大军，按照作战部署，在北疆地区分东西两个战场，同时向土匪发起攻击。
在此期间，人民解放军的总司令朱德至电王震将军：
新疆地大人少，土匪易产难消，除发展生产，改善生活以外，还需要控制交通工具，大量使用朝发夕至的坦克和装甲车等，使匪有所畏惧而不敢横行。
和独立旅为伊吾解围差不多同一个时间，解放军大规模的进剿开始了，被调集的部队从四面八方向北疆地区涌来，但开端却并不顺利。
剿匪部队以步兵为主，只有少量的骑兵和装甲兵，而土匪则全部是骑兵，两支部队在机动能力上不同，剿匪部队虽然作战努力，但鉴于步兵没有办法追上骑兵的马蹄子，所以屡屡不能抓住战机。
朱老总在给王司令员的电文里也提到了要大量使用坦克和装甲部队，以提高部队的机动能力，但巧妇难为无米之炊，第一野战军虽然有了长足的发展，但在几个大野战军里还是最穷的一个，别说装甲部队了。连骑兵都很少，装备。成了制约部队战斗力的一个紧要因素。
文化程度不高的解放军士兵以前缴获汽车以后还都是一把火点着烧了，因为没有人会鼓捣这些带轮子的玩意，直到最近才知道这是个好东西，但为时已晚，烧了的汽车变成了一堆废铁。
战士们后悔呀，以前在大山沟里打游击的时候感觉这些铁家伙没用，绕过来绕过去的还不如自己的两只脚走的快，到了大平原上才知道汽车很管用。不但能运输兵员还可以大量运输后勤物资，有人曾经计算过，一辆汽车的运输能力相当于几十辆的驴马车，没有了还真不行。
大匪首乌斯满裹胁了十几万匪徒四下做恶，但这十几万土匪并没有聚集在一起，而是分散开大大小小不同的数股，少时只有几百人打家劫舍。多的时候可以数千人在一起共同做乱，无数股大大小小的土匪把新疆弄的乱象横生。
针对土匪的特点，剿匪的解放军部队也把部队分成了若干支，以团一级别为骨干，四处抓捕，可是一段时间过去以后。剿匪部队的战果不大。
新疆不同于内地，以往的八路军和解放军与对手作战的时候，是用双脚行军打天下，靠的是两条腿翻山越岭走近道，才能跑的过敌人的汽车轮子。平原地区这个办法就不灵了。
广大的新疆地区地域辽阔，土匪的回旋空间大。很适合骑兵作战，在一马平川的戈壁草原与沙漠上，视线能看出去很远，往往剿匪的部队刚一露头就被土匪发现，而土匪凭
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