人勾结缅甸统治者，发动分裂祖国的叛乱。万历十年冬，罕虔夺木邦，欲据永昌；岳凤夺陇川，欲占腾冲。明木邦宣慰使罕拔之子罕进忠被迫逃往内地。罕虔及缅王北莽应龙等纠集了10万大军，以追捕罕进忠为名，于万历十一年正月二日‘破姚关，焚施甸，攻顺宁，寇猛淋，杀官军，剽焚为烈，恃象马所向无前‘，并谋‘五路寇全滇‘。滇西危急！
云南巡抚刘世曾一面从滇东往滇西调兵戍险；一面向朝廷告急，请求援兵。因邓子龙与倭寇周旋，功建闽广，有智勇声，朝廷派他率兵从江西驰援云南。邓子龙携兵三千，‘日夜兼程暴暑行‘，于五月十七日到永昌。他纵观形势，认为：陇川岳凤虽剧，僻西隅；耿马罕虔，居腹心，制全滇；得虔则凤为囊中物。遂率兵南指，出关时立誓：‘不复三宣诸郡，不擒罕岳诸夷，不平西南一统，不复入此关！‘兵至姚关，见‘白骨暴于榛莽‘，更加激起对敌仇恨，将士‘皆拔剑扼腕，欲一死战‘。邓子龙巡视阵地，细审要害，筑营垒，列烽堠，建坚营，设奇兵。十一月三日，敌军渡猛波罗，以象阵为前驱，气势汹汹，进逼姚关。邓子龙预先伏军于偃草坡，待敌至，火器齐发，敌军战象被击中，到处乱窜；强弩齐射，两翼伏兵突起，缅军惊溃，杀敌千余，尸横遍山，旗开得胜。次年正月二十日，又于湾甸用计大破缅军。敌退守耿马三尖山，经过周密调查，邓子龙于二月派兵从后山小路进袭，前后夹攻，生擒敌首，倾覆敌巢。‘渠魁擒，诸夷贡，诸郡复，地方平。‘邓子龙三战三捷，声振边陲。
为巩固边防，万历十三年，邓子龙率部在姚关筑城，并开清平、朝天、万仞诸洞；同时，建立‘恤忠祠‘，祭祀为国捐躯的将士，时人李士达、姜忻特为之撰书《恤忠祠记》。他们二人与邓子龙同时在永昌任职，他们同忧国难，‘同决战事，视姚关，走松坡，观营陈阵胜迹，赏服之无已‘。
1900年庚子事变，慈禧太后下令荣禄进攻东交民巷各国使馆，私下与联军保持关系的荣禄不想得罪列强，就找了一个绝好的借口：清廷的堂子就在御河桥东交民巷使馆区，若炮击使馆，势必危及堂子的安全，堂子中有清室视为保护神的邓子龙的庙宇。荣禄正是利用皇室对邓子龙的敬畏心理，达到了避战目的，果然，慈禧放弃了炮轰之举。由此可见，邓子龙在当时对皇室影响之大。
【丰城大打“子龙”牌】
现在，丰城市为了弘扬爱国主义精神，正大打“子龙牌”，以英雄的名字命名了新行政中心的主要道路和花园式商住楼，在杨柳湖景区文化墙设立了大型浮雕。在他的家乡杜市镇，人们矗立了他的巨型铜像，重修了省级重点文物保护单位邓子龙墓，其纪念馆也在设计当中。园艺场、彩瓦厂均以子龙命名，丰城地方特产东米塘，更是以“子龙”牌驰名中外；云南施甸、贵州晴隆也以邓子龙命名当地名茶，其中“将军绿”还获得“99昆明世界园艺博览会金奖”，邓子龙已经成为一个海内知名人物。