陆军大佐直接指挥的陆军一木支队，共约5800人）
(六)护航部队：（第二驱逐舰战队）司令官田中赖三海军少将
1、神通号轻巡洋舰
2、第十五驱逐舰分队：司令官佐藤四郎海军大佐
黑潮号、亲潮号驱逐舰
3、第十六驱逐舰分队：司令官涩谷紫郎海军大佐
雪风号、天津风号、时津风号、初风号驱逐舰
4、第十八驱逐舰分队：司令官宫坂义登海军大佐
不知火号、霞号、霰号、阳炎号驱逐舰
(七)水上飞机母舰部队：（第十一航空战队）司令官藤田类太朗海军少将
千岁号、神川丸水上飞机母舰
早潮号驱逐舰、35号巡逻艇
(八)扫雷部队：司令官本定知海军大依
第三玉丸、第五玉丸、第七昭南丸、第八昭南丸扫雷舰
16号、17号、18号猎潜艇
宗谷号供应舰、明洋丸、山福丸号运输船
(九)补给部队：司令官树尾二郎海军大佐
佐多号、鹤见号、玄洋丸、健洋丸号油船、明石号修理舰
四、北方编队：(第五舰队)司令官细萱戍子郎海军中将
航空母舰2艘，搭载舰载机82架，水上飞机母舰1艘，水上飞机10架，重巡洋舰3艘，轻巡洋舰3艘，驱逐舰12艘，潜艇6艘，扫雷舰5艘，运输舰3艘，补给舰3艘
(一)主力部队：司令官细萱戍子郎海军中将
若宫号水上飞机母舰、那智号重巡洋舰、电号、雷号驱逐舰、富土山丸、新山丸号油船
(二)第二机动部队：司令官角田觉治海军少将
1、航空母舰部队：(第四航空母舰战队)司令官角田觉治海军少将
龙骧号、隼鹰号航母，舰载机82架
2、支援部队：(第四[重]巡洋舰战队第二小队)司令官锅岛俊作海军大佐
摩耶号、高雄号重巡洋舰
3、警戒部队：(第七驱逐舰分队)司令官小西要人海军大佐
曙号、潮号、涟号驱逐舰、帝洋丸号油船
(三)阿图岛攻略部队：司令官大森仙太郎海军少将
1、阿武隈号轻巡洋舰
2、第二十一驱逐舰分队：司令官清水利夫海军大佐
若叶号、子日号、初春号、初霜号驱逐舰、真金丸号布雷舰
衣笠丸号运输船（运载穗积松年陆军少佐指挥的阿图岛登陆部队陆军北海支队，共1200人）
(四)基斯卡岛攻略部队：（第二十一[轻]巡洋舰战队）司令官大野竹二海军大佐
1、第二十一(轻)巡洋舰战队：司令官大野竹二海军大佐
木曾号、多摩号轻巡洋舰、浅香丸号辅助巡洋舰
2、警戒部队：(第六驱逐舰分队)司令官山田勇助海军大佐
响号、晓号、帆风号驱逐舰
3、输送船队：
白山丸号运输船（运载基斯卡岛登陆部队舞鹤镇守府第三特别陆战队）
球磨川丸号运输船（运载建筑材料和700名劳工）
4、第十三扫雷舰分队：司令官三冢俊男海军大佐
快凤丸、俊?丸、白凤丸扫雷舰
(五)潜艇部队：（第一潜艇战队）司令官山崎重辉海军少将
1、伊―9号潜艇
2、第二潜艇分队：司令官今里博海军大佐
伊―15号、伊―17号、伊―19号潜艇
3、第四潜艇分队：司令官长井满海军大佐
伊―25号、伊―26号潜艇
五、先遣编队：(第六舰队)司令官小松辉久海军中将
轻巡洋舰1艘，潜艇供应舰1艘，潜艇17艘
（一）香取号轻巡洋舰
（二）第三潜艇战队：司令官河野千万城海军少将
1、里约热内卢丸号潜艇供应舰
2、第十九潜艇分队：司令官小野良二郎海军中佐
伊―156号、伊―157号、伊―158号、伊―159号潜艇3、第三十潜艇分队：司令官寺冈正雄海军大佐
伊―162号、伊―165号、伊―166号潜艇
4、第十三潜艇分队：司令官宫崎武春海军大佐
伊―12l号、伊―122号、伊―123号潜艇
（三）第五潜艇战队：
1、第十一潜艇分队：
伊―173号、伊―174号、伊―175号潜艇
2、第十二潜艇分队：
伊―168号、伊―169号、伊―171号、伊―172号潜艇
六、岸基航空部队：(第十一航空舰队)司令官冢原二四三海军中将
岸基飞机214架，其中46架由机动编队的航母搭载
(一)中途岛派遣航空队：司令官森田千里海军大佐
零式战斗机36架、陆上轰炸机10架、水上飞机6架
（战斗机和轰炸机由机动编队的航母运载，计划直接转场至中途岛）
(二)第二十四航空战队：(第四空袭部队)司令官前田稔海军少将
1、千岁航空队：司令官大桥富士郎海军大佐
零式战斗机36架、鱼雷轰炸机36架
2、第一航空队：司令官井上左马二海军大佐
零式战斗机36架、鱼雷轰炸机36架
3、第十四航空队：司令官中岛第三海军大佐
水上飞机18架
损失和伤亡
美国：1艘航空母舰（“约克城”），1艘驱逐舰（“哈曼”），147架飞机（多为击落），307人阵亡
日本：4艘航空母舰（“赤城”“加贺”“苍龙”“飞龙”），1艘重巡洋舰（“三隈”），332架飞机(包括备用机，被炸毁于航母约280架，仅被击落42架)，3500人阵亡。