下两人遂成为了朋友，在以后的日子里她对林扬多有帮助，比如说暗地里赠送给林扬的那件出自于九天霹雳堂的法器“爆炎神弹”，若非有这东西拼命一击反杀，林扬早死在龙傲天手里了。
林扬是独孤燕仅有的朋友了，其他的人都知道她的身份，她的未来，对她毕恭毕敬不敢有半分冒犯，包括抚养她长大的绕云剑派前辈，只有林扬完全不在意这些，只把她当成最纯粹的朋友，可是后来，她这唯一的朋友也失去了。
当林扬叛逃，甚至谋杀暗害了天涯海阁的海辉子、海涛子两位鼎鼎大名的天才俊彦的消息传到绕云剑派的时候，独孤燕的第一反应并非恼怒仇恨，而是担忧，因为以她对林扬的了解，除非万不得已他绝不会主动去做这样的事情，必然是天涯海阁的那两个弟子先要对他不利！
说她盲目也好，偏听偏信也罢，反正她就是这么想的，错的不可能是自己的林扬师兄，一定是别人！
她甚至计划悄悄下山去寻林扬，林扬的本事她可是清楚的很，没有她的保护，怎么可能逃得过天涯海阁的追杀？
然而还没等她开始行动，天涯海阁就找上了门来，将对林扬的恼怒都发泄在了绕云剑派身上，当场重创了掌门和几个长老，更将林扬同期的师兄弟尽数灭杀，也只有她逃过一劫，被带到了天涯海阁，自此脱离绕云剑派正式成为了天涯海阁的门人。
独孤燕是聪明人，明白人在屋檐下不得不低头的道理，在天涯海阁暗中襄助林扬师兄也不错，然而她和林扬交好这件事情却没能守住，早有绕云剑派的人交代了出来，天涯海阁的那些长辈对此固然并不在意，但那些海辉子、海涛子的同门却对她极为排斥，视为仇敌，处处同她为难，所以她在天涯海阁的生活一点都不快乐。
紧接着又有难以置信的消息传来，先是天涯海阁的未来之星“沧海明珠”遭到偷袭失踪，连太上长老以术算之法演算天机都无法找出她的踪
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