造成了失控，自行进化，而且还改造和复活了本该被消灭的异生兽。此刻的扎基被称为“黑暗扎基”
面临这次的危机，似乎已经是避无可避。超新星的“来访者”们为了抵御扎基的威胁，竟然是自己犯的错，那么有自己来解决。
他们决定毁灭亲自自己的母星来消灭扎基！这就是M80天蝎座球状星云超新星爆炸的真相。
而黑暗扎基为此并没有受伤，他靠着爆炸的力量穿越的来到了光之国，到了光之国之后为了寻找诺亚而大开杀戒，在此战中无人可以与黑暗扎基匹敌，就连当时在光之国最强的奥特之王皮特，与之对战，最终对败。
黑暗扎基实力之强，几乎是横扫光之国，终于在此时，诺亚奥特曼出现了。
与黑暗扎基并没有多余的对话，他们的心中想说的，对方都已知晓。
身为诺亚奥特曼的分裂体，又还是可以称得上“黑暗之神”的扎基与宇宙第一道光的“光之神”诺亚奥特曼对战。
扎基的力量与诺亚平等，而诺亚拥有着诺亚之翼，力量在与扎基之上。最后因无法消灭身为自己的分裂体“扎基”，而封印了他。
最后诺亚拯救了光之国后消失，自此诺亚被光之国的人民说成是光之国的保卫者。
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