亲统十万大军由长江直入江西，与清军八旗统帅征南大将军谭泰战于九江，南昌城下，清军退却至南直隶，南昌城内的金声桓部，九江城内的王得仁部成功获救。
同时赣州城内的李成栋部北上赣江，在南昌城内与大军汇合。
一月之后，朱由榔亲统二十五万大军与清军满蒙八旗主力战于长江安庆城下，以两万士兵阵亡的代价夺取了安庆城。
清军八旗主力损失亦有两万余人。
谭泰屡次战败被满清摄政王多尔衮撤职，并将满蒙八旗主力撤回至长江北岸。同时授命总督江南大学士洪承畴为统帅，负责守卫南直隶。
洪承畴独木难支，在钱谦益的牵线联络下，再度投降大明，朱由榔携带二十万大军与福建焦琏，郑成功部五万水路大军齐入南京，收复金陵，至此南方七省宣告光复。
朱由榔在南方大力整顿吏制，开海贸易，赚得上千万军饷，国库粮食充裕。
永历七年，永历帝命焦琏为征虏大将军、吴继嗣、郑成功、张煌言为副将军，率军三十万，北进中原。
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