归附篡位叛乱的靖江王而被软禁，就是被焦琏解救出来的，而后他与焦琏并肩携手，一起平定过广西靖江王叛乱。
有了那一次生死之交，翟式耜对焦琏的为人也是颇为了解，知道他为人虽然粗鲁无鄙，内心确是个忠义耿直的汉子，朴实没什么心窍，远不像陈邦傅那般奸猾狡诈，野心勃勃。
想到焦琏大军马上就会到梧州勤王救驾，翟式耜终于大松了口气，不再彷徨无措了，对皇帝因为要安抚陈邦傅而罢免他首辅职位，他丝毫不觉得委屈，反而觉得皇帝能屈能伸，英明有决断，是个有为之君的料子，内心竟然老大欣慰，对自己的这个皇帝门生也真正的刮目相看起来。
“吾皇英明，老臣愿以驽钝之资，通力配合。”
等奏对结束，翟式耜请求跸辞，他刚走出密室，朱由榔温润的声音就从背后传了过来：“此生能遇到先生，是吾的荣幸。”
翟式耜听完，身子微颤，眼角隐有泪光闪现，他转身长揖一礼，清瘦的脸上已是一脸的坚毅：“君上礼遇之恩，臣无以为报，唯肝脑涂地，有死而已。”说完，大步踏出，不再回首。
第二天，朱由榔宣布罢免翟式耜首辅职位，将其贬为庶民，并以护驾之功升陈邦傅为庆远公，假斧钺，赐剑履入殿。
陈邦傅原本只是想让皇帝将翟式耜贬出梧州，省得碍事，没想到皇帝竟然直接将翟式耜的官职一撸到底，贬为庶民，虽然没有赶出梧州，不尽如人意，但他也不好意思再逼迫皇帝什么了，特别是皇帝再次给他加官进爵了，这让他原本有些警惕的心，又放松了一些，以为皇帝真的服软了。
这个时候，首辅瞿式耜削职为民，内廷司礼监掌印空缺，阁臣吴炳唯唯诺诺，再加上朱由榔的欲擒故纵，再三妥协，中枢明面上已经无人能与勋镇陈邦傅抗衡，梧州行在的军政大事基本他说了算了，直到这时，将堂堂天子和行在诸臣揉捏于鼓掌之间，陈邦傅终于有了一种天下在握的感觉，这种感觉太爽了！
然而随着李成栋平定义民叛乱，再次将兵
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