日暮时分，风云变幻，傍晚的彩虹转瞬即逝，紧接着便是黑云压城，妖风肆虐，大雨倾盆而至。
好在风向有所偏离，并未对郑军水师的鹿耳门路线构成致命威胁。不过要想渡过鹿耳门，仍然十分困难，不但要应对恶劣的夜间环境，还要抓住涨潮时期，稍有延误便前功尽弃，而且容易暴露航线目标，以后再想选择这条线路恐怕就不容易了。
在急行先锋舰“青龙”号地开路下，郑军水师趁着天黑风大雨大，视线和声音都模糊不清的情况下拔锚起航，朝鹿耳门连夜进发。
除了留下一个守卫营在澎湖岛上镇守接应，以防不测之外，郑军水师三万人几乎全部出动。加上朝廷派来增援的几千锦衣卫，明廷军队三万余人浩浩荡荡抢渡鹿耳门。
如此孤注一掷，他们只能成功，否则全军覆没，而且可能毁掉明朝水军的精锐，后果不堪设想。
除了开路的急行舰“青龙”号，朱青还命令两艘小型急行舰往澎湖方向驶去，一来随时盯着“赫克托”号的动静，二来提防北面来敌，一旦发现情况不妙，就算拼死相撞，也要阻止“赫克托”号回援鹿耳门，为郑军水师争取横渡鹿耳门的时间。
天公不作美，天气并未如郑成功所说的风恬浪静，此刻已经没有人再注意到所谓的天意！因为他们已经很难回头。好在这风雨虽然对舰队行程造成不小阻碍，可是也恰到好处了迷惑了荷军，迷惑了“赫克托”号。
在狂风暴雨之下，“赫克托”号并未发觉郑军水师在悄悄渡海。他们仍然抛锚抵御惊涛骇浪，甚至连外面的守卫都撤进了舱内。这场暴风雨为郑军水师的行动打了一个很好的掩护。
临近午夜，风雨未停，而郑军水师也丝毫没有怠慢，他们劈波斩浪，终于来到了鹿耳门。
鹿耳门，这条横亘在郑军水师面前的峡谷，因为水域由宽变窄，加上狂风暴雨，水面起伏非常之大，海浪在两岸激荡着，随时有吞没任何进入的船只的可能。此时海潮尚未涨潮，但是海浪已经把海平面颠高，然而这样的环境渡海是非常危险的，船只随时有可能被掀翻。
海潮未涨，大型战舰难以通过，郑成功命令小型战舰先行试水，可是几经尝试，都被海浪打回，有两艘战舰差点就被掀翻。
“将军，这一带的海浪太猛了，再不进去避风，咱们的小型战舰恐怕要栽在这港口！”郑宣冒雨想来汇报，方才就是他带头强渡的，可是都被打回来了。主要是在入口处海浪起伏太大，还没等船只进入内港，都被海浪打回来了，一旦进入内港，情况就好许多，毕竟鹿耳门也是不错的避风港。
“能不能把小型战舰前后连接在一起，这样既能通过狭长的港口，又能防止被海浪打翻。”郑成功很快想出了一个办法。
这办法听起来像是可行的，当初曹操挥师赤壁，就是把船连在一起，以抗风浪。既然现在敌人并未发现郑军
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