说做就做，京营的改革很快就拉开帷幕。
出于对兵权的慎重，朱由校并没有把京营改革全权托付给某个人，而是选择了亲自掌握每个细节。
可如此一来，原来的理政方式就出现了弊端。办事人员并不是每时每刻都能见到皇帝的，尤其是里面掺杂着大量低级官吏的时候，出入宫禁极其不便。
为了不影响工作效率，朱由校干脆设立了军机处，办公地点就选在养心殿。养心殿原是皇帝斋醮的地方，虽然和乾清宫、西六宫有门户相连，但相对独立。无论是朱由校过去处理政务，还是办事人员前来当值，都要方便的多。
既然设立了军机处，朱由校干脆又把自己熟悉的那套办公室设置搬了过来。一口气在军机处下面设置了司务厅、秘书厅、符宝厅、参军厅、通政厅和行人厅，这八个机构涵盖了整个秘书工作的流程，分别对应了办公室、文秘、机要、军事参谋、文件收发和执行监督等职责。
除了司务厅、符宝厅用内侍外，其他四个厅分别是从翰林院、勋贵武官、通政司和行人司中选人。为了防止有人插手进来，朱由校又特意设置了人事处和财务处，将军机处独立于内廷和外朝之外。
军机处一出，首当其冲的就是司礼监和内阁。为了安抚众人，朱由校忙说军机处是临时办事机构，等京营改革之后就会裁撤。
可这句话根本没有人信。
当初内阁成立的时候也是临时机构，而且还是咨询机构，可现在不也成了事实上的政事堂，统领起文武百官了。
可过了几天，大臣们却发现，皇帝处理政务的时候虽然换了地点，把御门听政变成了养心殿听政，却还是和阁臣九卿进行商议。
和以前有所变化的，不过是司礼监行文改成了军机处行文，同样是内阁副署，同样是部院办理。虽然京营大小事情都直接掌握到军机处手里，可京营大军本就是直属皇帝的，兵部以前是协理，现在还是协理，也没有太大的损失。
这
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