庆城将毁于战火，更多无辜百姓遭殃。当即宣布无条件投降，将部队拉到城外接受李斌改编。
所有部队在城外驻扎，李斌带五千人马携众将领进重庆城，维护治安，恢复集市。召开会议；推出知府，治理重庆，李定国任第一军团副军团长，把部队打散，编入第一军团内。让红娘子、高夫人归队。任命李如樟为都督，李如捂为总兵统辖贵州、云南广西、广东四省，率兵十万，配火炮100门南下平定。
重庆、贵州李定国治理的不错，当年还获得大丰收，但改革仍不彻底，农民的利益没有得到根本的保障。对富户、中产阶级打击太严厉，不利于安定大局，李斌给予纠正，放宽政策，鼓励经商，缓和矛盾，并派快马给裴文中送信，让陈新甲速调文官入蜀。
鉴于四川少数民族多、广、散，首先安抚，派出使者与首领交涉，和平共处，交出军队、武器，对于敢于反抗，不听劝告的给予严厉打击。由王虎、李定国率领第一军团5万人马西进，与四川遥黄土军激战，消灭残余部队，斩杀首领，没收一切刀枪兵箭，推出新的首领治理遥平。
李斌坐镇重庆度过几天清闲日子，红娘子却按耐不住，跑到李斌住处说：“王爷、为什么不让我领兵打遥平土军？是不是前两次的失误，王爷不信任我了。”
李斌笑道：“这跟信任没关系，打了这么长时间仗，你也该好好休息一下，累坏了李岩怪罪，我可担当不起。再说王虎是军团长，理应由他率领，为了今后战事，可以与李定国相互磨合，跟你没关系。我就不明白你看似娇柔的女子，怎么这么喜欢打仗？”
“对、我就是喜欢打仗，上马杀敌好不痛快，每天闲待在重庆城里，浑身上下都不舒服。”
李斌心想你这是贱，谁每天想过你死我活的日子？这时谢长顺匆匆走来：“报王爷，裴阁老来信，山东军情紧急，请示王爷调配军队。”