元惠宗与太子合好如初，见识过朱元璋厉害的太子跟其父皇如实说明情况后，父子俩知道不是朱的对手，竟然收拾行李携家眷逃往大漠了！常遇春与徐达率军入大都如入无人之境。
元惠宗在蒙古草原建立了新政权，始称北元，在太子央求下，赐何芊芊名黄真伊，假说是朝鲜贡奉来的公主，立为太子妃，次年，惠完去世，爱猷太子即位，史称元昭宗，立黄真伊（何芊芊）为权皇后。权皇后虽知一切不可挽回，却因思念朱元璋，又不习惯大漠生活，心存一丝侥幸心理，怂恿昭宗反攻中原。昭宗为爱所迷，应允。
同年朱元璋于应天宣布即皇帝位，定年号为洪武，国号为明。赐萨仁吉雅汉人名：马秀英（吉雅嫌土，仍自称吉雅），册封为皇后。
徐达、常遇春、李元忠，英明神武，所向披靡，先攻锦州，击败元将江文清；后攻全宁，击败元丞相相也速；军队继续不停，进攻大兴州，击败并生擒元相脱火赤。常遇春不顾临行前塔娜的劝说，大肆屠戮俘虏，在胜利回师途中，不幸患了“御甲风”，暴亡。塔娜闻之伤心欲绝，留儿子寄养给吉雅，出家为尼，为常遇春的罪孽祈祷求福。
元昭宗知形势逼人，终于重新启用扩廓，中原只剩下扩廓的军队还在日夜练兵，等侍着与朱的决战。
虽然，吉雅劝说皇帝留扩廓一条命，朱元璋应允,心中却有些吃醋，而苦守在大漠的何芊芊终于意识到自己不过是朱元璋战争里的一枚棋子,当了皇帝的他早已把她忘到九宵云外,她犹如走火入魔一般,明知不可为而为之，加紧逼扩廓攻打明军的步伐,扩廓终于对明宣战。双方交战多次，互有胜负。
最后一战,朱元璋安排徐达折腾扩廓的军队，白日里摆擂台，敲锣打鼓唱戏的方式麻痹对方，夜间搞小股兵力偷袭，令向来不屑于这种下三滥方式过招的扩廓不胜其烦。
在一次夜间突袭中，朱令大部队挥师齐上，扩廓猝不及防，惨败。在手下的死命劝说下，带着妻子乌斯格乐并十八护卫，渡黄河准备逃往大漠。
朱元璋率领庞大的军队乘胜追击，当他追至黄河岸边，望着扶着妻子艰难渡黄河的扩廓，脑海蓦然浮现了吉雅那既似忧伤、又似乞求的眼神，他的心猛地颤抖了一下，眼前的扩廓和当初那个风餐露宿、居无定所、受人打骂的小乞丐朱重八是多么相像！我曾经在元的统治下失去很多，如今我也得到很多——辽阔的国土、心爱的女人，还有什么看不开呢？就个人来说，你我本无深仇大恨，且彼此惺惺相惜，只不过各怀其志罢了，罢了
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