玉最初不愿承认，在湖广巡抚何腾蛟、巡按黄澍等人的劝说下，才同意开读，表示拥戴。然而，他的跋扈自雄却比在崇祯时期更加明显了。由于弘光帝主要是依靠马士英会同黄得功、高杰、刘良佐、刘泽清四镇拥立，左良玉没有参预到，算不上定策功臣，这让他耿耿于怀。
左良玉身边有许多读书人，逃到那的读书人，这些人无不对马士英和阮大铖恨之入骨，说白了，就是死仇。李自成有十几万人马南下，这些人再次开始鼓动左良玉。左良玉早年是东林党人侯恂一手提拔起来的，跟东林党人关系很好，与马、阮和弘光帝相互之间的信任度很有限。
打不过当然要跑，这才是左良玉的初衷，也符合他的自身利益，何况后面还有更加凶残的建奴会随后而来。左良玉需要理由，而这理由也是现成的。“假太子、童妃”案件闹得满城风雨，马士英、阮大铖的掌权又在官绅中引起强烈不满，这正好给左良玉提供了避战东下的借口。
三月二十三日，左良玉称奉先帝太子密谕前往南京救护，以讨伐马士英为名，全军乘船顺江东下。临行之时，左良玉下令把武昌居民屠戮一空。就这样，拥兵近八十万号称百万军，新朝重要的一个屏障左良玉成为了缩头乌龟。
左良玉与马、阮集团之间的矛盾，左良玉与李自成农民军的角逐，东林党复社与马、阮集团之间的党争，弘光朝廷与清的军事斗争，左良玉阵营内部的矛盾及“假太子案”等，都在这一历史事件中展现出来。
这是一场错误的战争，很多所谓“有识之士”认为左良玉有能力阻击李自成的进攻。可实际上，左良玉的所谓百万大军就是完全的乌合之众。至于作战能力，左良玉有这种举动已经说明了问题。
出兵需要“名义”，左良玉就四处散发檄文，表示发兵目的是“讨伐”奸臣马士英。
左良玉出兵前上疏揭发马士英八大罪状，非常具体。他手下文士所撰写的檄文，非常好看，可谓字字珠玑：“盖闻大义之垂，炳于星日；无礼之逐，严于鹰鹯：天地有至公，臣民不可罔也。奸臣马士
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