过6年大学士，入阁前只有礼部侍郎的虚衔，沒担任过院部堂官，是由翰林院直升上來的，用官场流行语來说，叫“下面沒人”，平时倒是沒什幺，下面的可以不算人，但到了当首辅的时候，在指挥不动时，才能感觉到下面的小罗卜头不仅是人，很难摆弄，必须认真对待，只有采取清理的办法，打一批，拉一批，目标控制得很精准才行。
官员里永远有靠上窜下跳进谗言吃饭的家伙，其哲学概念就是“做糖不甜做醋酸”，建设性的事情做不來，毁人的事很拿手，高拱的门生韩楫就是一个，高、张交恶，韩楫沒少“做醋”，张居正称之为“害政者”：“害政者”总是笑脸朝着有权势的，屁股朝着沒权势的人，高拱看到的都是可爱的笑脸，张居正恰恰有幸看到了许多人的屁股，说：“你们要换成笑脸也來不及了，‘二三子以言乱政，实朝廷纪纲所系，’所谓‘芝兰当道，不得不锄’者，我就是要拔了你们这些仙人掌！”
他不失时机地清理门户，隆庆六年六月，对南北两京四品以上官员进行考察，七月，对所有京官进行考察，锁定了目标，不是泛泛的开大尾巴会、表言不由衷的态，两次大扫除，共斥退吏部员外郎穆文熙等30余人，将吏部给事中韩楫等50余人调离京城，从庶吉士中补充了一些人进來，重建了言官队伍，又贬斥了一批尚书、巡抚级别的高官，时人说：“
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