府灭亡。继之而起的室町幕府大体上继承了镰仓幕府的统治制度，但它的主要支柱变成了独霸一方的守护大名，统治架构变成了幕府将军――守护大名――武士。事实上，在室町幕府的统治基础非常不稳，经常出现地方守护大名对幕府权威进行挑战的事件，战国时代有名的独眼龙伊达政宗家祖上就是个非常明显的例子。
公元1467年因将军和管领诸家继承问题引发的应仁之乱，绵延十年之久，权力中心城市的京都受到沉重打击，幕府威信荡然无存，室町幕府完全丧失对地方大名进行控制的实力，长期的战争也使幕府统治架构最底层的武士增强了实力，产生了将军受制于大名，大名受制于家臣的情况，也就是日人所谓的“下克上”。武家统治的主从关系完全崩坏，旧的幕府守护大名不是被消灭，就是转型为“战国大名”。这种“战国大名”依靠的是新兴的武士地主阶层，在名义上和实际上都脱离了幕府的统治。他们往往各自在自己的领地上发号施令，也企图恢复旧有的武家秩序，但作用甚微。
说了这些似乎很复杂，但如果细细一看便会发现日本的政体结构极其的不稳定！首先就表现在，日本人没有一个共同的政治领袖或者说他们从来没有去让一个人或是一个家族掌握整个国家的想法，也就是说古代的日本，政权的更迭就像是一场政治的联盟争夺战，每到一个统治集团失去势力或者说是失去民心的时候，下面的统治集团就会重新洗牌、寻找新的代言人，然后通过一两场不值一提的‘大战’将他推上前台。
日本的统治者，上到天皇、下到豪族，总是以一种混杂的方式维持统治，疆域内有国人众、宗教势力、豪族、武士知行、野武士领地，忍者里甚至还有海贼众，这些地方势力占据着或多或少的土地，如果再加上名下家臣的封地，大名的直领范围实在是比较可怜，很多大名的直辖力量不足以压服疆域内的其他势力，最后甚至被“下克上”地驱逐或是诛杀，如此层出不穷的事情让我不得不陷入深思，如果不想方设法改变这种局面，即便你获得了天下，又怎么能让自己的后代顺利地继续承袭下去呢？我可不是个大公无私的人，不会来到这个时代搞什么民主，更不可能让日本发展得太过强大，造成对祖国的巨大威胁，所以我必须更小心！其实说起来，我的野心并不大，或者说我这个人其实比较懒，如果可能的话，本能寺事变我会阻止它发生，这样的话跟着信长，统一天下，然后拿块大大的领地，我也就知足了，没必要非得争天下不可。
正因为这样，我就更要关注政权的组织形式，否则即使将来我得到更多的领地，又如何逃脱得了富不过三代的怪圈，让子孙后代享受到祖辈的资产呢！这办法其实咱们中国老祖宗早就在用了，就是独裁！统治者在自己的领域内必须拥有至高无上的权力，而要达到这个目的，最关键的就是要让所有臣属在经济上依赖我，所谓经济基础决定上层建筑，只有像中国的封建时代那样，普天之下莫非王土，封建地主要想保全土地那就必须在皇帝制定的规则下妥协！也许，尝试一下新的做法才是穿越者的真正金手指！