宪章不仅没死，反而重新集结章军，兵发台湾与日军大战。
消息传来，革命党人内部发生了激烈的争论。一部分人表示，周宪章有恩于革命党人，他率军与日本人争夺台湾，从道义上讲，革命党人应该向周宪章伸出援手；而另一部分人则认为，周宪章虽然有恩于革命党，但是，他现在其实就是一个军阀，一旦章军占领台湾后，周宪章必然会自立为王，革命党人的宗旨是消灭一切封建独裁，包括皇帝与割据者，建立民主国家，从这个意义上看，革命党人与周宪章志不同道不合，没有必要为了他消耗力量，而且，革命党人陷在的力量也不足，在国内的力量基本上损耗殆尽，在日本的海外力量十分宝贵，如果消耗在了台湾，很不划算。
就连潇湘三女杰的内部，也发生了争论。葛芸好坚决要求去台湾，帮着周宪章打日本人，秋瑾则是坚决反对把有限的力量消耗在台湾，唐群英不表态。其实，唐群英内心深处，是想去台湾的，因为，台湾的前巡抚、后来的台湾民主国总统唐景崧，是唐群英的堂叔，唐景崧现在寓居上海，朝思暮想着要打回台湾去，唐群英心底里站在他堂叔一边，只是，在革命党人眼里，唐景崧是朝廷鹰犬，唐景崧也对革命党夫人嗤之以鼻，双方水火不容，唐群英只好把自己的想法压在心底。
最后，还是孙文拍板决定，派出一支一百多人的革命军前往台湾，对周宪章进行一种象征性的援助。孙文的理由是，革命党人可以借此进一步拉近与章军的关系，与章军建立起合作，从而，在未来的反清活动中，争取章军的支持。革命党人现有的实力过于弱小，没有自己的武装，要想推翻满清朝廷，几乎是不可能的，如果章军占领台湾，并对革命党人提供帮助，那么，推翻满清建立共和就有希望了。
孙文把这个任务，交给了秋瑾，秋瑾在上海与周宪章打过交道，有一定的感情基础。
既然孙文做了决定，秋瑾也不好反对。就这样，革命党人在日本秘密活动，从美国购置了一批军火，从留学生中招募了一百多人，秘密训练。准备前往台湾作战。