定改红十六师为湘鄂赣野战军。同时进行省委党政领导调整，傅秋涛改任省委苏维埃主席。同年5月10日成立湘鄂赣人民抗日红军军事委员会、傅秋涛任主席。抗日红军军事委员会成立后，采取“快邮代电”方式发表声明，主张同国民党和平合作，一致抗日。经同国民党地方当局谈判，达成了停战条件。
抗日战争期间，1937年9 月至1938年1月，任湘鄂赣抗日军第一游击支队司令员。1937年12月至1939年1月任中共湘鄂赣特委常务委员。率领湘鄂赣根据地的武装力量，编入新四军。1938年1月，新四军军部成立，同时成立新四军军政委员会，直属中央军委，傅秋涛为委员。与此同时，南方各省红军游击队编成4个支队。湘鄂赣人民抗日红军游击支队编为第一支队第一团，傅秋涛任支队司令员兼一团团长。随后，率部离开平江嘉义奔赴抗日前线，按预定计划到达安徽屯溪、岩寺，与新四军军部会合。傅秋涛率部在岩寺进行整训后，同年6月奉命东进到江南的高淳、当涂、溧水3县交界地区，开辟敌后抗日根据地，开展抗日游击战。为粉碎日军的“扫荡”，率部两次进行了破坏宁芜铁路的战斗。1939年，队伍不断扩大，第一团扩编为新一支队（以区别于原陈毅的第一支队），任司令员。1939年11月，傅秋涛指挥部队与三支队配合在繁昌东郊城山头，予敌以重创，毙伤日军450余人。1940年4月，傅秋涛又指挥部队在父子岭伏击日军，歼敌370余人。同年10月，又在叶挺指挥下，奋勇迎击日军1万余人的大“扫荡”，夺回日军占领的泾县县城。1941年1月皖南事变前，傅秋涛任新四军皖南第一纵队司令员兼政治委员。在国民党顽固派制造皖南事变时，率部向北转移途中，遭到国民党顽军的突然进攻。傅秋涛奉命在原地构筑工事防守。随后，组织部队进行突围战斗，分散冲出重围，他所指挥的一纵队的干部战士也突围出来约1000人，占全纵队成员的三分之一，保存了新四军的一支骨干力量。傅秋涛用人得当。这是高明指挥员的高明之处。傅秋涛在大斧山危机的情况下，听取了汪克明的建议，在关键时刻分兵突围，放下包袱，组成精干的队伍，相继先后突围。皖南事变中傅秋涛部突围，处处充满“历史辩证法”：战场联络中断本是失败之征，但却使他能够独立行动，作出突围的正确抉择；战斗期间的较长会议本不可取，但却因为集中了大家的智慧，形成了正确的决议；反动道会门组织本是革命的对象，但却因为国民党的倒行逆施和共产党统一战线政策的英明，使他们帮助傅秋涛部逢凶化吉，而这一切又与傅秋涛的个人政治思想素质、军事素质和指挥才能紧密相连。突围到了盐城后，凡皖南突围出来的团以上干部，皆由新任的军参谋长赖传珠负责政审，确认无问题，做出组织结论后，再另行分配工作。傅秋涛在新四军盐城华东党校一边学习，一边接受审查，历时一年。这是一个逐渐理清傅秋涛皖南突围过程的必要的组织程序。
1942年3月傅秋涛被任命为驻安徽无为的新四军7师副师长（师长张鼎丞在延安，未到任）。1942年9月至1943年2月任中共皖鄂赣(皖江)区委员会代理书记。 1943
（本章未完，请点击下一页继续阅读）