背的，犯法的人怎能逃脱责任？”接着他下令杀了曾德。施琅杀犯法亲兵曾德再次触怒了郑成功，由此施郑矛盾升级，郑遂下令逮捕施琅父子三人。后来，施琅用计逃脱，郑成功大怒即杀施父大宣及其弟施显。施琅被迫降清，先任同安副将，继任同安总兵、福建水师提督。
施琅上任以后，积极训练水师，督造战船，选拔将领，全心筹措征台计划。康熙十九年，清朝平定“三藩”叛乱取得了决定性的胜利，庆功之时，施琅向康熙起奏，国家尚未统一，庆祝为时尚早，建议平叛军队全线东移，大兵压阵，解决台湾问题。施琅的奏疏遭到奈塔等人的反对。是年，在台湾，侍卫冯锡范和唐妃互相勾结，挟持年幼的延平王郑克爽，控制台湾大权，阴谋“自立乾坤”。董太妃以年迈之躯，支撑着台湾眼前风雨飘摇的局面，凛然宣布：“自立乾坤，分裂国土，我至死不为！若有再提自立乾坤者，杀无赦！” 在这种情况下，施琅对台方略，得到朝廷重臣李光地等人的支持，康熙皇帝十分赏识，起用施琅为福建水师提督。八月康熙皇帝在“御门听政”早朝中，把“进军澎台”的专征权交给了施琅。
康熙二十二年（1683年）六月中旬，一切筹备妥善，施郎率清军进军澎台。出征前夕，他将自己全家十几口人派送到各条战船，以示征战的决心。施琅指挥战船三百艘，将领士卒三万人从铜山港出发，乘南风之势，进军澎湖。经过五个时辰的激烈战斗，占领澎湖。郑氏败局已定之时，施琅不忙于进军台湾，而是着手做争取郑氏及其军队的工作。他厚待投降和被俘的郑军将士，稳定民心；同时建议朝廷“颁赦招抚”郑氏，以争取和平统一台湾。康熙同意他的招抚政策。施琅在澎湖“抚绥地方，人民乐业，鸡犬不惊”，甚至派人捞救跳水未死的郑军官兵，使得台湾、澎湖军民“莫不感泣，愿内向”。郑克爽、刘国轩见施琅“无屠戮意”，也愿意归顺，施琅不费兵卒地抵达台湾。
依常人之见，他攻台即是为报私仇，平台之后定当
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