功绩有两件：一件是在富兴镇收服了努尔哈赤的女真骑兵，壮大了明军的力量，并在战斗中不断武装和提升女真骑兵的战斗力，在历次战斗中都有他们的影子，并且屡屡以弱胜强，以少胜多，展现了非凡的战斗力，而这些都是与葬倭征讨军的主帅卢子秋的大力支持分不开的；第二件是卢子秋在前线不断取得胜利的同时，大肆为大明敛娶金银财物，以至于朝鲜王李岩与领议政大臣柳成龙多次上书哭穷，说是朝鲜之银大半入了卢大人的口袋，想來卢大人已经把这些钱充实到国库，为皇上分忧了。
万历皇帝震惊了，这两件事他事前并不知道，卢子秋在前线虽然定期会有密折回來汇报征战情况以及下一步的打算，可是这两件事却沒有涉及到，收服女真骑兵，敛取朝鲜金银，这两件事沒有一件是小事，这卢子秋竟然敢先斩后奏，秘而不报，他的居心何在，他到底想干什么？
本來还对卢子秋接连取得胜利而开心的万历皇帝此时此刻对于这个从來都不按常理出牌的臣子不免多了几分戒心。
首先女真骑兵虽然表面上归附明朝，可是私下里冲突摩擦不断，这一点卢子秋不会不知道；当日军侵入朝鲜之后，努尔哈赤也曾上表请求加入明军抗击日军，但是被万历皇帝毫不犹豫的拒绝了，这一点卢子秋不会不知道，他是他依然收下了努尔哈赤的女真骑兵，并大肆武装强大他们，他所图的难道只是为了抗击日军吗？
其次，朝鲜虽是大明属国，但是全国的银两却也充足，现在李岩与柳成龙竟然说大半之银都入了卢子秋的口袋，甚至说“卢子秋只患甚于日寇”，这简直是骇人听闻，自己本來还在为卢子秋不用国库拨一分一毫的银子而出兵朝鲜心存嘉勉甚至感激，现在看來这根本就是卢子秋敛财的手段之一，看來之前朕是太过相信他了，万历皇帝又想起了申思逸之前参卢子秋的奏折，浙江富商赵华旭家财何止百万，而到了卢子秋的口中竟然变得只有五十万，那多出的这些银两到底去了哪里。