要负责全军的装备工作。其组织机构设有办公厅、政治部、后勤部及综合计划、军兵种装备、装备科研订购、通用装备保障、外事等部门，下辖帝国军事研究所、直属军事学院。总装备部的直属军事学院是一所秘密军校，以培养保密技术兵种为主要任务，特别是通讯、潜艇、装甲以及今后的飞行员等等。
军事动员管理部，由原来的军管会改编，史令担任部长。下设省、府、县、村级军管会，主要职责是管理和组织各地民兵、预备役部队的建设，执行帝国地战时机制。设有办公厅、政治部、后勤、预备役和民兵训练机构。军管部有三大主要功能：其一，接收从部队退役的优秀士兵和军官，在农闲季节。用这些士兵和军官组织训练各级地方民兵和预备役士兵，以此构建中国的预备役机制。在中国兴起尚武之风。其二，在受到侵略时，以这些退役士兵和军官为骨干，组建地方抵抗武装力量；其三，遇到大规模战争，通过军管会，向农民征集余粮供应部队。与前苏联的“战时农民余粮无偿征集制”不同，中华帝国采取的是“战时有偿征集制”，即战争时期对国民征收余粮、余钱支持战争，战后通过免税的方式把征集的粮食和资金返还给国民。
在确立了国防力量的统帅机构后。帝国军队也进行了统一的整编，实行军区化管理。陆军方面拟建西北、蒙古、东北、西南四大军区，海军方面拟建北太平洋、西太平洋、东太平洋三大军区
支独立的南海舰队。在此之外，还要成立海陆混成直接保卫帝都地安全以及支援其他军区的作战。
西北军区总部设在伊犁，防守区域包括新疆、青海、甘肃三省，兵员以原帝国一军（1、2、101师。独立重炮旅）为基础进行扩充。军区司令徐军，副司令郑可桐、魏山，参谋长为刘文南。
蒙古军区总部设在库伦（今蒙古首都乌兰巴托），防守范围为蒙古全境，以原帝国二军（35、202，第一独立炮兵团）为基础进行扩充。军区司令王凡，副司令袁杰、冯相华，参谋长为吴佩孚。
东北军区总部设在哈城（今哈尔滨），防守范围包括东北三省以及朝鲜半岛，兵员以原帝国三军4102，8师（原卫二师）和朝鲜游击队为基础进行扩充，军区司令韩兴华，副司令刘成良、古大力，参谋长薛庆晓。潘义改任日本、朝鲜两属国行政总督。
西南军区总部设在桂林府（清末广西治所），防守范围包括云、贵、川、桂四省以及印度支那三国，兵员以第四军（6、7、420师）为基础扩充。军区司令刘永福，副司令为刘正南、冯相华，参谋长给正在军校受训地丁槐留着，而冯子
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