地方政权的建立是非常重要的。太平天国在建国后。改清廷“省、府、道、县”的行政区划方式为“省、郡、县”三级制，即取消“道”，改“府”为“郡”。
萧云贵和左宗棠商议后，重新划定了苏褔省的地方行政区划，更改后的苏褔省省会苏州，置有10郡70县。苏州郡治苏州，与长洲天县、吴县、元和3县同治一城，领10县：长洲天县（由清长洲县改）、吴县、元和、常熟（与昭文县同城治所）、昭文、昆珊（由清昆山县改）、新阳、吴江、震泽、东珊。
常州郡（清为常州府）治武进、阳湖，领5县：武进、阳湖（上两县同治常州城）、抚锡（由清无锡改为抚锡）、金匮（上两县同治无锡城）、宜兴、荆溪（上两县同治宜兴城）、江阴县。
太玱郡（改清太仓直隶州为太玱郡）治上海县。领5县：上海、镇洋、嘉定、宝珊（宝山所改后金珊亦同）、崇明。
松江郡（清为松江府）治花亭、娄县。领7县：花亭、娄县、菁浦（由清青浦县改）、奉贤、南汇、川沙、金珊。
杭州郡治钱塘、仁和两县，领9县：海宁、钱塘、仁和、富阳、余杭、新城、临安、于潜、昌化。
嘉兴郡治嘉兴、绣水两县。领7县：嘉兴、绣水（由清秀水县改）、嘉善、海盐、石门、平湖、桐乡。
湖州郡治归安县。领7县：归安、乌程、长兴、德清、武康、安吉、孝丰。
严州郡治建德县，领6县：建德、寿昌、桐庐、分水、淳安、遂安。
绍兴郡治珊阴、会稽两县。领8县：珊阴（由清山阴县改）、会稽、莦珊（由肖山县改）、诸暨、尚虞（由清上虞县改）、嵊县、余姚、新昌。
宁波郡治勤县，领6县：勤县、义县、奉化、镇海、象珊、定海。
如今的苏褔省比后世历史上李秀成东征后建立的苏褔省要大得多，因此新立的苏褔省郡县划出了10郡70县来。各郡设郡守衙门管治地方，各县设县令，再到乡、村则是按乡官制度编设（详见前文）。另在地方郡县设警察所，负责地方治安，乡村之地设乡兵所，负责地方治安，该地有驻正式兵马的则不受地方辖制，而是直接由兵部和西王府节制。
而各地方的郡守任命多是地方上的人物担任。比如苏州郡出任郡守的却是降了太平的许乃钊，只是许乃钊原是署理江苏巡抚，现在变为苏州郡守，就像是降职了一般，从省长降为市长。不过许乃钊却无怨言。因为他在钱塘的家族都保住了，因他已经降了太平，要是不尽心尽力为太平办事，满清打回来的话，他这种降官的下场可想而知，是以像许乃钊这种满清官吏不降则已。一旦降了之后，便发了疯似的要推翻满清，某些时候表现得更比老长毛还要狠毒。任用降官是一类，因为这些人熟悉地方政务，上手更快，而且萧云贵这么做也有千金买马骨的意思。在十郡七十县的郡守、县令之中。这类人占了三成。
第二类地方人物便是地方的头面人物，比如出任绍兴郡守的何文庆、宁波郡的黄春生等人，何文庆、黄春生都是帮着太平军攻略地方的义军，他们除了助太平军有大功之外，其实从前的身份也是一方豪强，黄春生家中就
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