1288年蒙古军第三次侵越失败后，元世祖忽必烈仍不希望就此终止对越战争。第二年，元帝仍打算向越南派兵，但因时间仓卒而未能继续。越南陈朝取得胜利后，随即派出使者到元朝，请求按前例向元朝朝贡。忽必烈亦无心恋战，应允和议，双方便恢复过往的宗藩关系。
1293年（重兴九年，三月改元兴隆），元朝要求越南君主入朝，但被拒，忽必烈又再计划出兵越南，设置“湖广安南行省”，集合兵马、军粮，准备水陆并进南征，然而在1294年（兴隆二年），忽必烈死，新继位的元成宗下令罢征，两国遂不再开战。
陈朝中期，偶尔有越南民众侵扰元朝边境的事件。1313年（兴隆二十一年）正月，有“交趾军约三万余众、马军二千余骑”入侵镇安州云洞、禄洞、知洞、归顺州等地，同年四月又有“交趾世子”领兵入侵广西养利州，焚烧官舍民居，杀害二千余人，元仁宗派员到陈朝交涉，陈朝政府反驳这只是边境盗贼所为，元廷加以警告，陈朝不予理会。1320年（大庆七年）十一月，有“交趾蛮侬志德”入寇元朝边境上的脱零那乞等六洞，元廷命守将击退。1326年（开泰三年）正月，有“安南国阮叩”入寇元朝思明路，元廷命湖广行省调兵防备。1330年（开祐二年），有“广源贼弗道闭”入寇元朝龙州罗回洞，龙州政府向陈朝交涉，陈朝不承认责任，认为事件只属“边吏生衅”，元朝湖广行省只好加强龙州边防。但大体而言，从蒙越战争结束到1368年（大治十一年）元朝覆亡，两国政府尚能保持友好关系，陈朝
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