(七)实行《禁运法案》，刺激民族工业发展。在杰斐逊的第二任期内，英国和法国争夺欧洲霸权和美洲殖民地的斗争日趋激烈。从1804年起，双方都禁止中立国船只与敌对国家进行贸易，企图用封锁的方法，来困死或扼杀对方。法国采取的是封锁欧洲大陆的政策，禁止所有欧洲大陆国家与英国通商。英国则依仗其强大的海军封锁了海洋，不仅禁止欧洲大陆国家与法国通商，而且禁止美国与法国通商，并拦截美国船只，无理捕捉美国水手，从1803到1807年，英国共捕获美国船只500多艘。在这种情况下，为了保障本国船只的航行安全和对抗英法两国的封锁政策，1807年12月22日，杰斐逊政府通过了著名的《禁运法案》，禁止一切美国船只离开国境驶往外国港口进行贸易;禁止某些英国工业品入口。《禁运法案》通过后立即生效，此后接连14个月，所有未去国外的美国船只，都只得停泊港内或仅从事沿岸贸易。《禁运法案》不仅使美国的船只和货物避免被捕获、毁坏，而且还避免了美国卷入国际武装冲突中的危险，维护了美国的独立自主权利。《禁运法案》的实施，使外国、特别是英国的工业品无法进入美国市场，因而刺激了美国工业的发展。过去一些一直从事海上贸易的资本家，纷纷把资本投入国内制造业，当时的美国普遍产生了一种放弃依赖外国货，发展民族工业的奋发精神。禁运期间，美国的毛纺织业、麻纺织业、造纸业、冶铁业等基础工业和其他工业生产迅速发展起来。从前需要从英国进口的货物开始在美国制造。《禁运法案》成为美国工业发展的前驱，但它使一向繁荣的美国海上贸易和航运业受到一定的损失。
(八)采取措施帮助印第安人由狩猎生活转向农耕生活。杰斐逊在任期间曾多次写信给印第安人酋长，劝说他们放弃原始的狩猎生活
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