前哨的作用在西方外交战略中的权重下降，加上此时的中东欧国家“回归欧洲”进程加快，土耳其入盟诉求在某种程度上被忽视了。
面对中东欧国家入盟带来的冲击，土耳其转而采取先争取与欧盟缔结关税同盟的策略，1996年双方缔结了关税同盟。土耳其本想以缔结关税同盟为基础再进一步推进入盟战略，但1997年欧盟卢森堡峰会虽然宣布土耳其有资格成为欧盟成员国，但却提出土要解决人权、尊重少数民族、解决塞浦路斯问题和妥善处理与希腊关系等一系列条件，令土耳其大失所望。1999年12月，在美国的积极推动下，欧盟赫尔辛基峰会确定土耳其为欧盟候选国，但仍以土耳其在政治、人权和法治等方面不符合欧盟标准为由，拒绝启动与土耳其的入盟谈判。
2005年，双方正式开启入盟谈判。不幸的是，土耳其又赶上了“欧盟疲乏症”影响，加上2006年因与塞浦路斯纠纷，欧盟干脆终止与土耳其继续进行谈判。其间经历多次反复后，2013年11月，欧盟与土耳其再次展开入盟谈判。2014年年初，土耳其与欧盟高层互访频繁，1月21日，土耳其总理埃尔多安造访欧盟。1月27至28日，法国总统奥朗德访问土耳其。高层互访让土耳其重燃入盟的希望之火。 2016年3月，欧盟与土耳其一度达成难民安置协议，被视为土耳其加速入欧的政治博弈成果，然而7月中旬土耳其发生未遂军事政变，更让其免签待遇生效和入欧谈判进程搁置，双方关系再次陷入僵局。
与非洲的关系
为保持经济增长和对经济转型的调控，土耳其与非洲的贸易额已经翻了一番多，由2003年的50亿美元增长至2007年的120亿美元。土耳其的目标是到2010年将这一贸易额增加至300亿美元。土耳其外贸部门公布的数据显示，截至2007年底共有150家土耳其公司在23个非洲国家投资直接投资总额已达到5亿美元，这一数字预计将进一步增长。