朱元璋将军权一分为二：统兵权归属五军都督府，调兵权归属兵部。以文制武，文官发号施令，武官带兵打仗。
卫所士兵平时在属地屯田，战时朝廷军令一下，各地卫所集合成军，皇帝指派五军都督府的武将为总兵官，带兵出征。
待到战事结束，卫所士兵各回原卫，继续屯田，而武将上交将印，回到五军都督府。如此，将不专军，军无私将，杜绝了武将带兵叛乱的可能。
除切割军权外，朱元璋对各地的军官也加强了监视，他不仅在各个部队中派遣义子监军，还派遣特务人员暗中监视。
为防将领与公侯串联，洪武五年朱元璋还特地颁布军律，禁止卫所的将领接受公侯赠与的财物，禁止卫所的将领在非战争时期出入公侯的府邸。
而且，如果公侯没有皇帝的特旨，不得私自差使卫所的将领与士兵。公侯违反军律，三犯准免死一次（免死权限减少一次）；将领与士兵三犯发海南充军。
为防功勋将领造反，朱
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