分科考试，科目有：律法，度支，小学，天文，历法，书画，辞赋，水利，算学，医术，农学，语言，兵事，地理，机械，音律等。各部按照各自所需选拔人才。
这方案基本符合了万历的要求。三级考试最难的不是会试，而是乡试，会试大多重复乡试的内容，殿试的难度还有所降低。而乡试的录取办法又无疑为某些专长人士打开了方便之门：六场考试只要三四场优秀即可过关，可以规避一些科目。总的说来，这样的设计，保留了儒学的地位，又给了其它人机会和路径。
如此变动，也还是引起了朝官的哗然，赞成者有之，反对者有之。在朝堂之上，议论纷纷。
高坐在上的万历微微一下，咳嗽一声，堂上立马安静下来。万历方才说道：“朕知晓诸卿心有疑惑。朕要说的是：夫子座下弟子三千，身通六艺者七十有二。礼、乐、御、射、书、数谓之六艺，礼官长于礼；乐师长于乐；车夫善于御；军士善于射；书生精于书；账房精于数。这都是先师传下的学问，只有先后却无贵贱。人各有其才，国家诸职位所需也不一样；朝廷设立科举选拔人才，也不当有所偏废。朝廷一如既往的尊重读书人，敬重斯文。”万历停顿下来，锐利的目光一一扫视殿中诸大臣，“朕说的的读书人绝不是以荣华富贵出人头地为目的的沽名钓誉之辈，更不是只知道背诵圣贤文章的迂腐文人，而是真真正正有才华有能力的国家栋梁！朝廷的官位并不属于你们哪一个人，而是属于整个江山社稷！朝廷的俸禄更不是来自于书本上的空谈，而是几千万老百姓忍着烈日酷暑肩挑背扛一点点积起来的。朕言尽于此，诸卿好自为之。退朝！”
如然斋。
万历退朝后，即便召见申时行，王赐爵，许国，王家屏等内阁学士。见礼后，万历示意他们坐下，说道：“这科举改革，朕意已决。不管什么人反
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