军队无条件向独立军投降。
1904年6月23日，闽浙战役结束，福建浙江并入军政府势力范围，设福建省，浙江省。吴佩孚，福建组，情报局相关人员都受到了或公开，或隐秘地表彰，吴佩孚更是因功提升为少将，升任民族独立军第四师师长，原四师师长吕远调入新成立的党卫军另安排重任。
但离福建一海之隔，《马关条约》中被割让给日本的小岛台湾发生的事，却冲淡了胜利的喜悦。1904年6月28日，日本台湾总督儿玉源太郎发表申明，指责了军政府对闽浙发动的“野蛮的，无耻的袭击”，并警告军政府，一旦日本在台湾的利益受到任何形式地威胁，大日本帝国精锐的军队会毫不留情地给于挑衅者以惨重地打击。
这份让李国勇几乎气炸了肺的申明还没等他做出反应，日本驻上海总领事小田切万寿之助的到访，让他真切感受到了日本的强横和威胁。
小田的突然来访，是为了俄国军舰“满洲”号而来。
俄舰“满洲”号于1903年12月12日自旅顺来沪，日俄战争爆发后奉俄海军部之命，滞留上海。日本方面多次要求军政府驱逐该舰，但都被得到李国勇授意的上海市长周高远所拒绝。恼羞成怒的日本，公然将军舰“秋津州”号驶进了沪北张华浜，以武力威胁军政府。
李国勇冷冷地看着对面那个染他感到厌恶的日本人，冷淡地问道：“领事先生了从来不登我的大门，今天来，为了什么事啊？”
傲慢的小田说道：“今天我代表大日本帝国给你们所谓的军政府送来了最后通牒！”
李国勇看了眼坐在旁边的杨度，才将目光重新投向小田：“最后通牒？本帅倒很想听听你们日本的通牒。”
小田清了清嗓子：“大日本帝国通牒伪军政府及伪大元帅李国勇阁下，阁下及阁下的下属，置中国正统政府大清帝国的‘局外中立’政策于不顾，公然袒护俄罗斯军舰‘满洲’号，严重损害了日本利益。现大日本帝国通知李国勇及其伪政府，必须于1904年7月2日前驱逐俄舰‘满洲’号，否则由此引发的一切严重后果由伪大元帅李国勇及其伪政府自负！
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