在那之后，因陀罗另立门派，创立了尊崇武力的忍术派别。忍宗自此分裂成两个势成水火的体系。六道仙人将拥有写轮眼的不得志刻成石碑保存下来，可惜他没有想到这会被黑绝利用篡改，仙人的一片苦心最终都化作流水。
后来，就像因陀罗宣布的那样，二人间的战斗不曾停息，漫长而无止尽，不断地重复着。而在这些争战中，憎恨引发了更大的憎恨，膨胀到无法收拾的地步。战斗直到阿修罗与因陀罗死后，仍在继续。宇智波一族成为了故事的主角，黑绝充分利用了他们以及那块石碑，把内容改成了无限月读才是拯救宇智波一族的唯一途径。
二人的遗志被不断传承下，出现在新人体上，他们的后代就是千手柱间与宇智波斑，直至最后便是宇智波佐助和漩涡鸣人。因陀罗的后裔是宇智波一族与羽衣一族，阿修罗的后裔是千手一族、漩涡一族以及金角银角的先祖。而代代相传的阴阳双剑是六道仙人留给大弟子双海护身的兵器。
最终六道仙人羽衣走完了一生，临死前将尾兽们分散到世界各地，就是旅行时选中的故乡，祈祷它们能安然度日。可是终究事与愿违，在悠久的历史中，企图滥用尾兽力量的人层出不穷，磨光了它们对人类的耐心。
对于黑绝而言，复活辉夜有两个必要条件，一个是神树，一个是轮回眼释放的无限月读。然而轮回眼所必需的羽衣的查克拉，却分散到了因陀罗和阿修罗身上。能够组成十尾的尾兽们，也分散到了世界各地。想要复活辉夜，就必须集齐这全部的要素。
黑绝不得不经历一段漫长的岁月，为了重新凑齐羽衣的查克拉，它利用了在继承人战斗中败北的因陀罗。因陀罗的后代是宇智波一族，成为黑绝故事中的主要角色。羽衣留下的宇智波家的石碑，被黑绝稍稍做了修改，[只有无限月读才是拯救宇智波的途径]，而宇智波一族却毫不知情，表演得非常出色。
因陀罗与宇智波，阿修罗与千手，彼此为追求力量而争斗的情节达成了。自那以后不知道进行了多少次，黑绝接近因陀罗和阿修罗的查克拉继承者，诱导他们争斗，试图激发轮回眼，却一次次遭遇了失败。仅仅是执行这些步骤，黑绝就花费了一千多年。
当继承者变成宇智波斑和千手柱间时，黑绝终于确信，斑有能力做到轮回眼的开启。这是复活辉夜的第一步。终结谷大战，千手柱间虽然击败了宇智波斑，但是斑咬了柱间一口血肉，得到了柱间的细胞。黑绝看见斑似乎死了，非常失望，以为一切又回到了起点。但命运似乎开了个玩笑，斑的尸体对忍者而言就是一座宝库。潜心研究写轮眼之谜的扉间，没有处理掉尸体，而是把斑藏到了木叶的深山。斑也不傻，他算准了即便败在千手手下，扉间也不会处理掉自己的尸体。于是对自己施展了术。
万花筒写轮眼能够以时间差把术放在眼中，斑将伊邪纳岐放在了右眼之中。他以右眼为代价改写现实而得以复活，然后将影分身装成了尸体。斑吐出了从柱间身上咬出了血块，将其移植到自己的伤口上。一直到晚年，斑才成功地开启了轮回眼，召唤来了外道魔像，并且用魔像来培育柱间肉块细胞，意图获得永生。在这个过程中，他偶然获得一个魔物，那就是柱间细胞组成的白绝。可事实上这不过是曾经中了无限月读的人们，从魔像中提取出来而已。
[两股相反的力量相互作用，得森罗万象。]斑一如石碑镶刻的文字那样，对柱间的执念愈发强烈。黑绝让自己成为了斑的意志影子，假装是斑创造了自己，操纵带土，开始了回收尾兽的计划。在黑绝白绝的帮助下，带土促使了晓结成，引导他们走向了战争。
为了增强战斗力，黑绝故意让兜发现了斑的尸体，并引导他将斑的尸体作为交易筹码，为带土提供助力。然后第四次忍界大战使得无限月读开始按照计划发动了，大量分散在各地的人类查克拉被集中在一起。辉夜复活的必要条件似乎达成了，然而谋事在人成事在天，战局的变化之快令黑绝都难以掌控。羽衣和羽村虽然不在世，但他们各自留下了预防措施，终究是阻止了辉夜复活。
——故事结束（详情观看动画680-688集）—————