甲午战后，清政府与日本签订了《马关条约》，宣布放弃对朝鲜的宗主国地位。日本借机在朝鲜扩张势力，但遭到当时主政的闵妃的坚决抵制。“玄洋社”认为若想在朝鲜扩大亲日势力，必须先除掉闵妃。头山满积极与日本驻汉城公使三浦梧楼谋划刺杀方案，1895年10月8日凌晨3时左右，“玄洋社”组织40余名日本浪人，夜闯闵妃寝宫――景福宫，以极其残忍的手段将闵妃杀害并焚尸灭迹。
在甲午战争期间，清政府曾多次抓到“玄洋社”派出的间谍，俄国政府也宣布该社成员为“不受欢迎的人”。在西方人眼中，“玄洋社”更成为诟病日本的把柄。“玄洋社”不仅在国外罪行累累，其在国内也是大搞“顺我者昌，逆我者亡”的恐吓活动。1889年2月21日，即《大日本帝国宪法》颁布当日，文部大臣森有礼在准备出席颁布仪式时，就是遭到“玄洋社”派出的刺客西野文太郎暗杀身亡。8个月后，与“玄洋社”政见不同的外务大臣大隈重信，又遭该社成员来岛恒喜的炸弹袭击，大隈重信被炸断了一条腿。遇刺后，大隈重信宣布辞去外相之职。
迫于国内外舆论压力，为了继续“玄洋社”的事业，头山满不得不另起炉灶，图谋东山再起。此时，声名鹊起，年仅26岁的内田良平进入了头山满的视线。内田良平，1874年生于日本的福冈，出身武士家族，其叔父是玄洋社社长冈浩太郎。受到家族影响，内田良平从小就嗜武，经常与浪人交游。年轻的内田良平就已经参与玄洋社在国内外的各种阴谋活动。
1901年2月3日，内田良平、葛生修吉、平山周等56人在东京神田锦辉馆成立“黑龙会”。在会上，内田良平宣读了建会宗旨、会规，随后他又被推举为“黑龙会”的总负责人。而“玄洋社”的另一个头目头山满，则被聘为顾问，成为“黑龙会”的幕后主使。
“黑龙会”这一名称
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