见最亲近的下属和友人送来礼物、却之不恭时，才会在礼物中挑选一两样最不值钱的东西留下，余者则悉数退还。当时的江苏督军、后来成为汉奸的齐燮元曾送给段祺瑞一件几扇镶嵌着各种宝石的屏风，五光十色，非常惹眼。段祺瑞的家里人都喜欢得不得了，都盼望段能留下这件宝物。谁知第二天再看，宝物不见了，原来段祺瑞一早就派人将屏风归还给了齐燮元。只有一次例外，段祺瑞将别人送的礼物照单全收，那便是冯玉祥送来的一个大南瓜。1926年6月，段祺瑞欠黎元洪7万元，后因无力偿还被黎告上法庭，这件事足可说明段祺瑞在执政期间确实是一名清廉的官员，没有多少家财。
中国数千年家天下和世袭传统的熏陶，使得位高权重的官员总想要荫及子孙。“一人得道，鸡犬升天”的现象在中国历史上已是屡见不鲜，但是在段祺瑞这里却是个例外。段家家规很严，夫人和姨太太都不准干预公事。有一位姨太太想替老妈子的亲戚谋个差事，段祺瑞立即予以制止，表示自己不会做出卖官鬻爵的事情。段祺瑞的儿子段宏业从小寄养在亲戚家，十几岁才回到段祺瑞身边，小时候由于缺少良好的教育，所以文化水平不算高。不少人劝段祺瑞给儿子在政府部门安排个职位，段都没有答应，在他看来自己的子女们应该靠自己，从最底层做起，一步步上升，不能一下子就做官。胞弟段祺甫来京求大哥给自己找个官做，段祺瑞也是一口回绝，给了他一些钱回去做买卖。
段祺瑞下台之后，经济来源减少，1928年蒋志清得知段祺瑞生活确实有些周转不灵，随即送上2万元，在此后三四年间，又送过数万元，生活问题才得到解决。
段祺瑞下台后，主要居住在天津。1930年2月，冯玉祥和阎锡山联合反蒋，日本人认为有机可乘，密谋策动“北洋派大同盟”，拥戴段祺瑞和吴佩孚为领袖，组织华北傀儡政权，以控制华北地区。在特务头子土肥原贤二的策划之下，段祺瑞和溥仪曾在天津有过一次密谋的会晤，不过双方都不愉快。事后有人问及，段祺瑞生气地说：“鄙人不才，忝为国家元首，这
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