他来到马来亚后发现反对阵营存有两种不同势力，左派真正目的是结束英国统治，是真正危险所在。
而苏丹和巫统祗要求恢复战前保护国地位，他们要求马来人有特权，其矛头并非针对英国，而是反对轻易给非马来人公民资格。
麦克唐纳授意放弃马来亚联邦的政策，由英殖民政府、马来苏丹和巫统三方代表组成宪制工作委员会，重新起草一部新宪法，这个宪制工作委员会故意不让左派和非马来人(即华人和印度人)参加。
终于在十二月底制定新宪法，并以蓝皮书形式公布，蓝皮书把马来亚联邦改称马来亚联合邦，新加坡仍分割出去。
联合邦有强大的中央政府，由英国委任最高统治者，掌握行政立法大权，只是不再称为总督而改称高级专员。
各土邦苏丹大体恢复昔日名义上的统治者地位，蓝皮书强调马来人的特权，对非马来人取得公民权规定了比白皮书更为苛刻的条件。
这蓝皮书引起以华人为主的非马来人反对。
全马联合行动委员会，马华公会等组织号召举行罢市、罢课，整个新加坡的动脉骤然停顿，其它马来亚城市也陷于瘫痪状态，但麦克唐纳不理会总休业，坚决成立马来亚联合邦及执行偏袒马来人的新宪法。
英国殖民当局将马来人拉到自己一边后，便于1948年6月12日，突然在霹雳州宣布进入紧急状态，又在全马来亚半岛实施紧急法令，授意军警任意捕人和杀人的无限权力。
于是全国各地的特务，警察、军队大举出动，袭击工会、左翼政党、人民团体社团，搜捕民主人士、反英份子，宣布马来亚国民党、全马总工会、马来亚华人抗日军退伍军人协会、青年团等党团为非法组织，血腥镇压和屠杀以华人为主的无辜人民。
仅六月二十日晚，全马各地就有以华人为主的六百多人被捕，三百多个以华人为主的工会和社团被封。
这年年底，已有以华人为主的13341人被关进监牢或被驱逐出境，以华人为主的四百多人被屠杀，主要针对华人的白色恐怖笼罩全马。
英殖民者宣布进入紧急状态的目的是企图以突然袭击的办法，先发制人，把以华人为主的反对力量一网打尽。
但有很多工会和社团的骨干份子在反白皮书和蓝皮书的斗争中已认清英国迟早会下毒手，在大搜捕前已转移他处。
当年的华人抗日军纷纷走回森林中，重新拿起武器进行自卫斗争，并成立以华人为主的马来亚民族解放军。
英殖民者把马来亚民族解放军诬蔑为土匪，把这场镇压以华人为主的战争对国际描绘成维持治安的警察行动。
英国殖民当局发动了剿匪月，调动数万正规军，以飞机大炮、坦克、装甲车等现代化军事装备妄图在一个月内将以华人为主的马来亚民族解放军消灭。
在剿匪月结束时，英国保守党议员甘蒙承认在剿匪月英国保安队的伤亡比解放军严重，竟成五与一之比。
前殖民大臣在议会大声疾呼：我请求政府把整个马来亚问题看作首要问题，假如我们在马来亚打败仗一切都完蛋。
后来新上任的田普勒高级专员上任后，从东非、斐济、
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